Сын известного португальского вратаря и тренера Феликса Моуриньо. Последнее время работал с командой английского клуба «Челси», с которым расстался 19 сентября 2007 года по обоюдному согласию.

До 16 лет играл в любительской Лиге Португалии. Работал помощников тренера Бобби Робсона в футбольном клубе Порту (Futebol Clube do Porto) и Барселона (Futbol Club Barcelona).

В 2000- х гг. являлся главным тренером португалского клуба Бенфика (Sport Lisboa e Benfica) и Порту.
Сейчас считается одним из лучших тренеров в Европе. Сумел за два года завоевать все европейские трофеи с «Порту» и привести «Челси» к чемпионскому титулу после 50-летнего перерыва.

2001-2004гг. Главный тренер футбольного клуба Португалии Порту

2004-2007гг. Главный тренер футбольного клуба Челси, Великобритания

Достижения:

* Победитель Лиги чемпионов УЕФА: 2004
* Обладатель Кубка УЕФА: 2003
* Чемпион Португалии: 2003, 2004
* Обладатель Кубка Португалии: 2003
* Чемпион Англии: 2005, 2006
* Обладатель Кубка английской лиги: 2005, 2007
* Обладатель Суперкубка Англии: 2005
* Обладатель Кубка Англии по футболу: 2007